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第二章 细胞自噬:大隅良典的酵母与外推的边界

吃掉自己的细胞

「自噬」(autophagy,意为「自己吃自己」)一词由发现溶酶体的克里斯蒂安·德迪夫(Christian de Duve)在 20 世纪 60 年代提出。在电子显微镜下,可以看到细胞用双层膜把自身内部的一部分,包括整个线粒体,包裹起来,送到溶酶体这个消化区室去分解。没有人知道细胞是怎么做到的,也不知道涉及哪些基因。这个过程发生在微小而短命的结构里,很难观察,因而很难研究。

大隅良典的实验

20 世纪 80 年代末,在东京工作的大隅良典选择了面包酵母。酵母有一个大液泡,相当于溶酶体,在普通光学显微镜下就看得见。他推想:如果酵母会自噬,送进液泡的物质会被消化得太快而看不到。于是他使用缺少液泡主要消化酶的突变株,并让它们挨饿。

证据

缺乏蛋白酶的酵母在氮饥饿数小时内,液泡中充满小球状结构,每个外包一层膜,内含细胞质、核糖体,有时还有线粒体;这些「自噬小体」在拥有消化酶的饥饿细胞中,或在营养充足的突变株中都不出现 (Takeshige et al. 1992)。随后大隅良典与 Miki Tsukada 筛选在饥饿下不能积累自噬小体的突变株,鉴定出第一批自噬基因(APG,后统一改称 ATG)(Tsukada and Ohsumi 1993)。2016 年诺贝尔生理学或医学奖授予大隅良典,「以表彰他发现了自噬的机制」(The Nobel Assembly at Karolinska Institutet 2016)。

大隅良典在酵母中发现的基因,在动物和植物中都有近亲,它们编码的机器现在已了解得很详细:一个感知营养、启动过程的复合体;一套构建双层膜的系统;以及一种标记膜的蛋白,酵母中叫 Atg8,哺乳动物中叫 LC3,实验室用它来测量自噬 (Mizushima and Komatsu 2011)。自噬的意义远不止于饥饿:它清除受损的线粒体和蛋白质聚集体,参与免疫和发育。自噬基因的缺陷与神经退行性疾病、炎症性疾病等相关 (Levine and Kroemer 2019)。

从酵母到人的一跃

流行的版本是这样讲的:断食开启自噬;自噬清洁细胞;所以断食清洁全身包括大脑的细胞,并延缓衰老。每一步都部分正确,但整体在人身上并未确立。薄弱环节在于时间、组织与测量。

时间:谁的一天?

大隅良典实验中的酵母被完全剥夺了氮,这是任何人都不会经历的状态。动物研究更接近一些,但动物通常是小鼠,而小鼠的生命节奏比人快得多。

推导

在哺乳动物中,每公斤体重的能量消耗大致与体重的 −1/4 次方成正比(克莱伯定律)(Kleiber 1932)。一只 25 克的小鼠,每公斤体重的能量消耗约为 70 公斤的人的七倍,耗尽糖原和脂肪的速度也相应更快。

mouse_kg, human_kg = 0.025, 70.0
# energy use per kg scales as body mass ** -1/4 (Kleiber)
scale = (human_kg / mouse_kg) ** 0.25
print(f"a mouse burns energy per kg about {scale:.1f} times faster than a human")
for mouse_h in (24, 48):
    days = mouse_h * scale / 24
    print(f"a {mouse_h} h fast in a mouse ~ {days:4.1f} days of a human's metabolic time")
# a mouse burns energy per kg about 7.3 times faster than a human
# a 24 h fast in a mouse ~  7.3 days of a human's metabolic time
# a 48 h fast in a mouse ~ 14.5 days of a human's metabolic time

这种换算只是经验法则,不是精确换算,但它是一个警告:让小鼠肝糖原耗尽、深度酮症的 24 小时断食,在代谢上更接近人断食数日,而不是人少吃一天的饭。所谓人类自噬「第 16 小时开启」或「第 48 小时达到高峰」,背后没有直接的人体测量。

组织:哪个器官?

证据

水岛昇等人培育了细胞中带有荧光 LC3 的小鼠,从而可以计数自噬体。禁食 24 至 48 小时后,骨骼肌、肝脏、心脏等多种组织中的自噬体大量增加,但大脑几乎没有变化 (Mizushima et al. 2004)。后来,迈赫达德·阿里雷扎伊(Mehrdad Alirezaei)等人用另一种计数方法报告,24 至 48 小时的短期限食确实增加了小鼠皮层神经元和小脑浦肯野细胞中的自噬体 (Alirezaei et al. 2010)。

两项小鼠研究对大脑的结论并不一致,而且都是禁食一到两天的小鼠,按上面的换算,那是一次长断食。人断食 16 小时会不会改变人类神经元的自噬,目前不知道。

测量:通量还是标志物?

自噬是一种流动:膜形成、吞入物质、与溶酶体融合、被消化。一张显示自噬体更多的快照,可能意味着生成更多,也可能意味着清除更少。所以实验室指南坚持测量通量,通常的办法是阻断溶酶体,看会多积累多少 (Klionsky et al. 2021)。这在细胞和动物中可以做到,在活人身上非常难。

证据

在一项针对 11 名超重成人的随机交叉研究中,与在早 8 点到晚 8 点进食相比,连续四天的早时限进食(只在早 8 点到下午 2 点进食)提高了全血中自噬基因 LC3A 的表达 (Jamshed et al. 2019)。作者把它报告为一个自噬标志物的变化;血细胞中的基因表达,并不等于肌肉或大脑中的自噬通量。

能合理地说些什么

假说 · 尚未验证

尚未确立。 在人身上,一天或更长的断食很可能像在小鼠中一样,增加肌肉、肝脏等部分组织的自噬;但效应的大小、所需的时间及其对健康的影响都不清楚,也没有直接证据表明每天 16 小时的断食会改变人脑的自噬。如果有人体研究在已知时长的断食前后,在组织样本中测量自噬通量(而不只是标志物),就能支持这一假说;如果长达 48 小时的断食不改变人类肌肉的自噬通量,假说就被推翻。

注

自噬并不简单地等于「好」。它是一个有最佳范围的内务过程。太少与疾病相关;太多可能损伤细胞,有些癌症还利用自噬求存。「更多自噬」不是健康目标,本书也不把它当作目标。

所以,这个诺贝尔故事的诚实总结是:大隅良典揭示了细胞在饥饿时如何消化自己,由此开创了一个对医学十分重要的领域。他没有证明人的断食能清洁大脑。那个问题仍然开放,第九章的试验也不试图回答它;它问的是一件可以在人身上测量的事:一种断食时间表会不会改变注意力。

参考文献

Alirezaei, Mehrdad, Christopher C. Kemball, Claudia T. Flynn, Malcolm R. Wood, J. Lindsay Whitton, and William B. Kiosses. 2010. “Short-Term Fasting Induces Profound Neuronal Autophagy.” Autophagy 6 (6): 702–10.
Jamshed, Humaira, Robbie A. Beyl, Deborah L. Della Manna, Eddy S. Yang, Eric Ravussin, and Courtney M. Peterson. 2019. “Early Time-Restricted Feeding Improves 24-Hour Glucose Levels and Affects Markers of the Circadian Clock, Aging, and Autophagy in Humans.” Nutrients 11 (6): 1234.
Kleiber, Max. 1932. “Body Size and Metabolism.” Hilgardia 6 (11): 315–53.
Klionsky, Daniel J. et al. 2021. “Guidelines for the Use and Interpretation of Assays for Monitoring Autophagy (4th Edition).” Autophagy 17 (1): 1–382.
Levine, Beth, and Guido Kroemer. 2019. “Biological Functions of Autophagy Genes: A Disease Perspective.” Cell 176 (1–2): 11–42.
Mizushima, Noboru, and Masaaki Komatsu. 2011. “Autophagy: Renovation of Cells and Tissues.” Cell 147 (4): 728–41.
Mizushima, Noboru, Akitsugu Yamamoto, Makoto Matsui, Tamotsu Yoshimori, and Yoshinori Ohsumi. 2004. “In Vivo Analysis of Autophagy in Response to Nutrient Starvation Using Transgenic Mice Expressing a Fluorescent Autophagosome Marker.” Molecular Biology of the Cell 15 (3): 1101–11.
Takeshige, Kazuhiko, Misuzu Baba, Shigeru Tsuboi, Takeshi Noda, and Yoshinori Ohsumi. 1992. “Autophagy in Yeast Demonstrated with Proteinase-Deficient Mutants and Conditions for Its Induction.” Journal of Cell Biology 119 (2): 301–11.
The Nobel Assembly at Karolinska Institutet. 2016. The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2016: Press Release. 3 October 2016. https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2016/press-release/.
Tsukada, Miki, and Yoshinori Ohsumi. 1993. “Isolation and Characterization of Autophagy-Defective Mutants of Saccharomyces Cerevisiae.” FEBS Letters 333 (1–2): 169–74.

Fan, Y. (2026). Fasting, Ketones and the Metabolic Basis of Attention: Autophagy, β-Hydroxybutyrate and the Bioenergetics of Intermittent Fasting [断食、酮体与注意力的代谢基础] (Version 1.0.0). 5D Library. https://doi.org/10.5281/zenodo.23684203 · Licensed under Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0).